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罗氏诊断推出新款基因分析软件,可解读长链碱基序列
http://cn.newmaker.com 6/10/2014 2:22:00 PM  日经BP社
罗氏诊断推出新款基因分析软件,可解读长链碱基序列罗氏诊断日本公司(Roche Diagnostics Japan)于2014年6月9日开始销售能够利用该公司的新一代NDA测序器一次解读更长的碱基长度的软件和专用试剂。一次能解读的碱基数量(读长)从原来的平均约400个扩增到平均约700个,因此可降低单个碱基的解读成本。

罗氏从2010年6月开始销售与研究室水平的实验规模相符的新一代测序仪“GS Junior Bench Top System”。此次改进了软件和专用试剂,开始提供能够一次解读更多的碱基的“GS Junior+Bench Top System”。老用户无需购置新硬件,只需更新软件即可升级。

此次新采用了长读长测序(Long-Read Sequencing)技术,可填补重叠群之间的间隙,减少追加实验。另外,还可分析跨越多个多样性区域的碱基序列,能够满足更大范围的需求。比如,可用于尚未破解的新基因组序列的解读(de novo测序)、转录组分析、宏基因组分析、HLA配型等。

转录组分析是指,通过掌握某生物个体、组织及细胞的转录产物(mRNA)的全貌来了解研究对象的基因表达的全貌。宏基因组分析是指,通过提取环境中含有的、源自微生物的DNA,包罗性地研究碱基序列,从而查明环境中的微生物群落拥有的基因群。HLA配型指的是识别人类组织相容性抗原——HLA(人类白细胞抗原)的类型。(记者:大下 淳一,《日经数字健康》)

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